La BNCF è stata ed è tuttora impegnata in diversi progetti di ricerca e di sviluppo.

Si tratta sia di progetti internazionali (come Bibliotheca Universalis), sia di progetti europei (NEDLIB e CASA) finanziati congiuntamente al 50 per cento dall'Unione Europea e dal MBAC.

Altri progetti di ambito nazionale sono finanziati interamente dall'Ufficio Centrale per i Beni librari e, tra questi, da segnalare quelli (come Arsbni) promossi con le risorse derivanti dai Fondi del lotto.

I progetti sono suddivisi tra quelli attualmente in fase di realizzazione e quelli già portati a compimento.